How to apply a disc shaped mask to a NumPy array?
I have an array like this:
>>> np.ones((8,8))
array([[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]])
I'm creating a disc shaped mask with radius 3 thus:
y,x = np.ogrid[-3: 3+1, -3: 3+1]
mask = x**2+y**2 <= 3**2
This gives:
>> mask
array([[False, False, False, True, False, False, False],
[False, True, True, True, True, True, False],
[False, True, True, True, True, True, False],
[ True, True, True, True, True, True, True],
[False, True, True, True, True, True, False],
[False, True, True, True, True, True, False],
[False, False, False, True, False, False, False]], dtype=bool)
Now, I want to be able to apply this mask to my array, using any element as a center point. So, for example, with center point at (1,1), I want to get an array like:
>>> new_arr
array([[ True, True, True, True, 1., 1., 1., 1.],
[ True, True, True, True, True, 1., 1., 1.],
[ True, True, True, True, 1., 1., 1., 1.],
[ True, True, True, True, 1., 1., 1., 1.],
[ 1., True, 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]])
Is there an easy way to apply this mask?
Edit: I shouldn't have mixed booleans and floats - it was misleading.
>>> new_arr
array([[ 255., 255., 255., 255., 1., 1., 1., 1.],
[ 255., 255., 255., 255., 255., 1., 1., 1.],
[ 255., 255., 255., 255., 1., 1., 1., 1.],
[ 255., 255., 255., 255., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 255., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.],
[ 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1.]])
This is more the result I require.
array[mask] = 255
will mask the array using center point (0+radius,0+radius).
However, I'd like to be able to place any size mask at any point (y,x) and have it automatically trimmed to fit.
Answer
I would do it like this, where (a, b) is the center of your mask:
import numpy as np
a, b = 1, 1
n = 7
r = 3
y,x = np.ogrid[-a:n-a, -b:n-b]
mask = x*x + y*y <= r*r
array = np.ones((n, n))
array[mask] = 255